Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
C4AP0C0L4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C4AP0C0L4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms