Protein–RNA interactions for Protein: P09564

CD7, T-cell antigen CD7, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD7P09564 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD7P09564 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD7P09564 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD7P09564 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD7P09564 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD7P09564 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD7P09564 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD7P09564 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD7P09564 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD7P09564 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD7P09564 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD7P09564 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD7P09564 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD7P09564 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD7P09564 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD7P09564 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD7P09564 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD7P09564 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD7P09564 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD7P09564 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD7P09564 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD7P09564 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD7P09564 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD7P09564 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CD7P09564 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD7P09564 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD7P09564 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD7P09564 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD7P09564 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD7P09564 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD7P09564 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD7P09564 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD7P09564 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD7P09564 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD7P09564 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD7P09564 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD7P09564 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD7P09564 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD7P09564 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD7P09564 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD7P09564 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms