Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTBP09497 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTBP09497 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTBP09497 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTBP09497 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTBP09497 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTBP09497 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTBP09497 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTBP09497 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTBP09497 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTBP09497 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTBP09497 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTBP09497 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTBP09497 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTBP09497 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTBP09497 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLTBP09497 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLTBP09497 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLTBP09497 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLTBP09497 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CLTBP09497 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLTBP09497 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLTBP09497 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLTBP09497 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTBP09497 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTBP09497 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTBP09497 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTBP09497 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTBP09497 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTBP09497 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTBP09497 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTBP09497 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTBP09497 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTBP09497 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTBP09497 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTBP09497 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTBP09497 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms