Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGAVP06756 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAVP06756 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms