Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC3P02656 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC3P02656 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC3P02656 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC3P02656 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC3P02656 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC3P02656 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
APOC3P02656 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC3P02656 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC3P02656 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC3P02656 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC3P02656 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC3P02656 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC3P02656 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
APOC3P02656 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOC3P02656 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOC3P02656 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms