Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GGPS1O95749 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGPS1O95749 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms