Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms