Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP3O75154 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms