Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF5BO60841 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF5BO60841 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF5BO60841 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms