Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOX15O60248 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SOX15O60248 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SOX15O60248 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SOX15O60248 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SOX15O60248 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX15O60248 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX15O60248 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms