Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OIP5O43482 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OIP5O43482 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OIP5O43482 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OIP5O43482 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OIP5O43482 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OIP5O43482 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OIP5O43482 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OIP5O43482 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OIP5O43482 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OIP5O43482 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OIP5O43482 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OIP5O43482 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OIP5O43482 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OIP5O43482 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OIP5O43482 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OIP5O43482 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OIP5O43482 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OIP5O43482 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OIP5O43482 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OIP5O43482 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OIP5O43482 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OIP5O43482 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OIP5O43482 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OIP5O43482 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OIP5O43482 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OIP5O43482 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OIP5O43482 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OIP5O43482 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OIP5O43482 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OIP5O43482 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OIP5O43482 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OIP5O43482 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OIP5O43482 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OIP5O43482 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OIP5O43482 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OIP5O43482 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OIP5O43482 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OIP5O43482 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OIP5O43482 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OIP5O43482 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OIP5O43482 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OIP5O43482 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
OIP5O43482 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OIP5O43482 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
OIP5O43482 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OIP5O43482 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OIP5O43482 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OIP5O43482 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
OIP5O43482 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OIP5O43482 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OIP5O43482 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OIP5O43482 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
OIP5O43482 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OIP5O43482 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms