Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRXO43186 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRXO43186 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRXO43186 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRXO43186 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRXO43186 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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