Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLXNB1O43157 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLXNB1O43157 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms