Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFIT3O14879 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFIT3O14879 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFIT3O14879 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFIT3O14879 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFIT3O14879 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFIT3O14879 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFIT3O14879 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFIT3O14879 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFIT3O14879 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFIT3O14879 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFIT3O14879 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIT3O14879 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms