Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
HMGB1P1B2RPK0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms