Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC169A6NNP5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC169A6NNP5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms