Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms