Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GMNCA6NCL1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMNCA6NCL1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms