Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VWA3AA6NCI4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms