Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MTMR11A4FU01 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms