Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM89A2RUT3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM89A2RUT3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms