Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A0U1RQF3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A0U1RQF3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms