Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 TEX26-AS1-211ENST00000589840 865 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 LINC01483-205ENST00000591334 620 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AL445223.1-201ENST00000595998 1051 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AL139317.4-201ENST00000605879 760 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 XRCC6P3-201ENST00000422187 1621 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 TGIF1-223ENST00000618001 3030 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 NPIPB5-207ENST00000451409 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 RWDD1-204ENST00000487832 1427 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 ZNF345-202ENST00000420450 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 EPHA7-201ENST00000369297 1885 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 DEFB105A-201ENST00000334773 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 CENPW-202ENST00000368326 443 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 CCNYL3-201ENST00000407030 998 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 RPE-204ENST00000411934 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 RPSAP2-201ENST00000416785 888 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 RBMS1P1-201ENST00000417216 1156 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC111200.2-201ENST00000418877 505 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC098617.1-202ENST00000428980 1207 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AL606534.2-201ENST00000436756 624 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC105942.1-202ENST00000438509 952 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC104695.1-201ENST00000439700 849 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AL050402.1-201ENST00000440477 770 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC002366.1-201ENST00000446186 1190 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC074051.1-201ENST00000470389 781 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC018695.1-201ENST00000484096 664 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 RN7SL28P-201ENST00000488836 298 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 RNA5SP460-201ENST00000516789 100 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC114550.1-201ENST00000518846 573 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC004241.1-203ENST00000552502 460 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC133485.3-201ENST00000562604 262 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC138907.3-201ENST00000563937 262 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC138869.2-201ENST00000569850 262 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC026401.2-201ENST00000576454 503 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 GATA6-AS1-201ENST00000579431 481 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC006238.1-201ENST00000609787 534 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC245041.1-201ENST00000619523 826 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 FBXO38-201ENST00000296701 3680 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 USP37-204ENST00000418019 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 C1GALT1C1-202ENST00000371313 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 CYP2C19-202ENST00000480405 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 NUMB-211ENST00000554521 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 TIMD4-201ENST00000274532 1369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 CCDC30-202ENST00000342022 3098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC105383.1-202ENST00000505289 2820 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 STAT2-202ENST00000418572 1548 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 SSBP2-212ENST00000509053 1534 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDK4Q16654 GAGE2A-201ENST00000362097 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms