Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 LDB2-203ENST00000502640 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 CYP2C8-211ENST00000539050 2024 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 STC1-201ENST00000290271 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 CSRNP3-203ENST00000409420 2545 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 NLRC5-203ENST00000436936 6724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 CCDC39-201ENST00000442201 3279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ZNF19-201ENST00000288177 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 NLN-201ENST00000380985 8661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 CACNA1C-205ENST00000399591 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 CACNA1C-206ENST00000399595 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 CACNA1C-207ENST00000399597 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 CACNA1C-208ENST00000399601 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 CACNA1C-217ENST00000399641 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 CACNA1C-218ENST00000399644 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 NOP14-AS1-207ENST00000515194 3860 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 PPIP5K1-202ENST00000348806 5433 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 LINC01694-202ENST00000441095 6721 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 CDH11-202ENST00000394156 6874 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ZNF185-204ENST00000370268 4305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 MAT1A-201ENST00000372213 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 DTL-206ENST00000542077 4471 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ST3GAL6-201ENST00000265261 3362 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 CSF2RA-203ENST00000381500 1283 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 REG3G-203ENST00000409471 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 DLG5-AS1-201ENST00000449852 487 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 LINC01431-203ENST00000452395 505 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 RN7SL233P-201ENST00000469988 277 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 KCND2-201ENST00000331113 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 MORF4L2-210ENST00000451301 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 CASP8-205ENST00000358485 2930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 NOTCH2-201ENST00000256646 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ABCC11-201ENST00000353782 4463 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 FADS1-211ENST00000536991 2701 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 KPNB1-202ENST00000535458 3163 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 EYA3-202ENST00000373864 2459 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 PHF6-204ENST00000370803 4489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 SERPINB2-201ENST00000299502 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 PCDH9-204ENST00000544246 6234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 PTER-203ENST00000423462 3212 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC009169.1-201ENST00000563784 1377 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 CLIP1-203ENST00000361654 5568 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 OR10H3-201ENST00000305892 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 NOX4-203ENST00000375979 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 MS4A6A-203ENST00000426738 1736 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 RPL24P8-201ENST00000446071 474 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 CASC9-201ENST00000504531 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 OR4N1P-201ENST00000554847 949 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC022405.1-201ENST00000559841 516 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 pRNA.12-201ENST00000614353 90 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 pRNA.3-201ENST00000615048 90 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 OR10H3-202ENST00000641646 1029 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 GALC-203ENST00000393569 2547 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ADA2-202ENST00000330232 3195 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 SERPINA9-203ENST00000380365 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AL121835.2-201ENST00000624253 3502 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ZNF423-203ENST00000561648 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 HS6ST3-202ENST00000620595 7073 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 GBP7-201ENST00000294671 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ZNF106-203ENST00000565380 5677 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ATP1A2-201ENST00000361216 5421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 PRDM1-201ENST00000369089 4675 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 FAM13A-205ENST00000503556 3386 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ATP8A1-201ENST00000264449 8209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 C6orf106-201ENST00000374021 916 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 YWHAZP3-201ENST00000415292 738 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC011747.1-201ENST00000425678 565 ntTSL 4 BASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 G6PC2-204ENST00000429379 645 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 MTND6P19-201ENST00000519399 524 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC008708.2-201ENST00000522956 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC068014.1-201ENST00000576836 413 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
POLR2AP24928 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms