Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms