Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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SNX13Q9Y5W8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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SNX13Q9Y5W8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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