Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C3Q9Y5Q9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms