Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CD2APQ9Y5K6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD2APQ9Y5K6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD2APQ9Y5K6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD2APQ9Y5K6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD2APQ9Y5K6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD2APQ9Y5K6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD2APQ9Y5K6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD2APQ9Y5K6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD2APQ9Y5K6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD2APQ9Y5K6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD2APQ9Y5K6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD2APQ9Y5K6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD2APQ9Y5K6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD2APQ9Y5K6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD2APQ9Y5K6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms