Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4BQ9Y4P1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4BQ9Y4P1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4BQ9Y4P1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4BQ9Y4P1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4BQ9Y4P1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4BQ9Y4P1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4BQ9Y4P1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4BQ9Y4P1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4BQ9Y4P1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4BQ9Y4P1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4BQ9Y4P1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4BQ9Y4P1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG4BQ9Y4P1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG4BQ9Y4P1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG4BQ9Y4P1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG4BQ9Y4P1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG4BQ9Y4P1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4BQ9Y4P1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms