Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NRXN3Q9Y4C0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NRXN3Q9Y4C0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms