Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO2Q9Y3B8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO2Q9Y3B8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO2Q9Y3B8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO2Q9Y3B8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO2Q9Y3B8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO2Q9Y3B8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO2Q9Y3B8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO2Q9Y3B8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO2Q9Y3B8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO2Q9Y3B8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO2Q9Y3B8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO2Q9Y3B8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms