Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF13Q9Y2Y9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms