Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAN1Q9Y2M0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAN1Q9Y2M0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms