Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPSEQ9Y251 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms