Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GINS2Q9Y248 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms