Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POMPQ9Y244 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POMPQ9Y244 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms