Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HDAC5Q9UQL6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC5Q9UQL6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms