Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms