Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF18Q9UNG2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF18Q9UNG2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms