Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPUSD1Q9UJJ7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPUSD1Q9UJJ7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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