Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HACL1Q9UJ83 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HACL1Q9UJ83 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms