Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAX2Q9UIW0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms