Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MBD1Q9UIS9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MBD1Q9UIS9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms