Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PUF60Q9UHX1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUF60Q9UHX1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms