Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX20Q9UHI6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX20Q9UHI6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms