Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms