Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CFDP1Q9UEE9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CFDP1Q9UEE9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms