Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RRBP1Q9P2E9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRBP1Q9P2E9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms