Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTTNBP2NLQ9P2B4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms