Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MIS18AQ9NYP9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MIS18AQ9NYP9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
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